Так и не понял, где это настроить, программа развивается, а ее настройка становится все более неочевидна..
Догадываюсь, что в предложенном варианте ape будет декодирован в wav, который без труда вопсроизведет PS3.
В этом случае можно будет слушать только весь диск целиком, от начала и до конца, ни о какой навигации по трекам речи не идет
Но я говорил о поддержке ape + cue
Cue - индексный текстовый файл, который показывет программе-плееру, где начинается один трек и заказнчивается другой. В приведенных мной ранее ссылках все очень подробно расписано и разжевано

От транскодера требуется, чтобы он "попилил" этот большой wav на отдельные треки.
Пример cue-файла
REM GENRE Synthpop
REM DATE 1984
REM DISCID 770A360A
REM COMMENT "ExactAudioCopy v0.99pb4"
PERFORMER "Alphaville"
TITLE "Forever Young"
FILE "Alphaville - Forever Young.ape" WAVE
TRACK 01 AUDIO
TITLE "Victory Of Love"
PERFORMER "Alphaville"
INDEX 01 00:00:00
TRACK 02 AUDIO
TITLE "Summer In Berlin"
PERFORMER "Alphaville"
INDEX 00 04:14:72
INDEX 01 04:17:00
TRACK 03 AUDIO
TITLE "Big In Japan"
PERFORMER "Alphaville"
INDEX 01 09:02:45
TRACK 04 AUDIO
TITLE "To Germany With Love"
PERFORMER "Alphaville"
INDEX 00 13:46:32
INDEX 01 13:47:17