Симптомы, запускаю файл .mkv на воспроизведение, в верхнем углу экрана пишет его характеристики (разрешение, используемые кодеки) потом на пару секунд темный экран, затем выкидывает назад на экран со списком воспроизведения. Через HMS те же симптомы.
55LE5500 не воспроизводит mkv с "header removal compression" (включено по умолчанию в mkvmerge v4.1.0 и выше) https://www.bunkus.org/answers/?qa=7/an ... g-matroska
Выдержка из статьи.
Для решения проблемы при муксинге (я использовал mkvmerge) нужно отключить компрессию заголовков для каждого видео- и аудио-трека: Extra options → Compression = noneHere's a list of hardware and software players that do not implement this part of the specification. This list is most likely outdated as updates are released by the authors and manufacturers.
Software:
DivX thumbnail component
mplayer and derivatives (e.g. KMPlayer)
SolveigMM DirectShow demuxer
tsMuxer
VideoLAN Client/VLC (Fixed in the meantime. Version 1.1.2 and newer work correctly.)
Hardware:
Asus O!Play and O!Play Air
Brite View CinemaTube
Samsung LED TV
Sony SMP-N100
Western Digital TV Live HD/WDTV (also see http://wdtv.uservoice.com/forums/17442- ... n-matroska ; supposedly fixed in a firmware that's currently in testing)

В версиях mkvmerge старше 4.3.0 (начиная с 4.4.0) можно отключить компрессию заголовков по умолчанию: File → Options

Интересно можно это фиксить на лету в HMS?
P.S.
Да, узнать что mkv c "header removal compression" можно через программу MediaInfo (или в HMS с версии 1.28.2)
Смотреть во всех секциях (видео и аудио) наличие параметра Режим смешивания : Header stripping